控制測試中不一定適用審計抽樣，只有當控制運行留下軌跡時注冊會計師才采用審計抽樣測試內部控制。例如，根據內部控制的規定，貴重的大宗存貨的入庫驗收必須有采購經理、倉儲經理和財務經理在場，但實際驗收時是否如此嚴格執行，往往不會留下審計軌跡，因而必須詢問并實地觀察。