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大病醫療專項附加扣除是指在結算個人所得稅時，納稅人可以通過申請，額外享受支付的稅收優惠政策。
一般來說，大病醫療專項附加扣除的計算流程如下：
（1） 核實確診情況
首先，納稅人或其他符合條件的納稅人需要提供有效的醫療機構出具的大病確診證明，用以證明病情屬實，以及交易病癥的醫療費用的實際支出。
（2） 認定支出
在認定大病支出時，只有當支出符合國家規定的大病類別的時候，才能成為合法的扣除費用，工商銀行稅務機構核定后才可以成為大病支出。
（3） 由稅務機構確認
稅務機構根據納稅人提供的相關流水和確診證明，確認大病支出的資格。
（4） 計算扣除數額
最后，依據大病醫療費用的實際金額，計算大病醫療專項附加扣除數額。
說明：
1、大病類別包含15項，包括腦癱、白血病、兒童腦癱、膽囊結石、良性腦腫瘤、癲癇、結核病、惡性腫瘤、甲狀腺病、女性內分泌疾病、冠狀動脈病性心臟病、脊髓灰質炎、心肌炎、急性腎衰竭、心力衰竭。
2、支出大病費用需要滿足以下幾個條件：
（1）大病支出的實際支出時間應在申報當年；
（2）稅務機關核定的大病項目；
（3）大病支出的相關收據必須完整；
（4）大病支出金額可以由當地財政部門指定的醫院出具收據或前年度財務費用報表來證明。
拓展知識：關于大病醫療專項附加扣除，國家還提供了一種專項扣除，即納稅人或納稅人的配偶、子女發生重大疾病的臨時醫療費用，每人每年允許扣除6萬元，凡是已扣除大病醫療費用，不再從6萬元中扣除，但若未參加新農合、商業醫療保險，就可以從6萬元中扣除費用。
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