選項A，游艇以艇身長度為計稅依據；
選項BD，摩托車、商用客車以輛數為計稅依據；


選項C，商用貨車以整備質量噸位數為計稅依據。


故選BD。【提示】此類知識點可在《考點匯編-應納稅額》進行學習。