選項A,B：房屋買賣，以成交價格作為計稅依據，成交價格包括承受者應交付的貨幣（40萬元）、實物（80萬元）、無形資產或其他經濟利益對應的價款；
所以甲企業用原材料換取乙企業廠房應納契稅=（80+40）×3%=3.6（萬元）。


選項C,D：房屋互換，以互換房屋的價格差額為計稅依據，互換價格不相等的，由多交付貨幣、實物（商品）、無形資產或其他經濟利益的一方繳納契稅；


所以甲企業用廠房換取丙企業辦公樓應納契稅=50×3%=1.5（萬元）。