選項A錯誤，選項D正確，個人將其所得通過中國境內非營利的社會團體、國家機關向教育、公益事業和遭受嚴重自然災害、貧困地區的捐贈，捐贈額不超過應納稅所得額的30%的部分，可以從其應納稅所得額中扣除；選項B正確，個人直接捐贈的，不得稅前扣除；選項C正確，個人通過非營利的社會團體和國家機關向農村義務教育的捐贈，在計算繳納個人所得稅時，準予在稅前的所得額中全額扣除。 故選BCD。
【提示】此類知識點可在《考點匯編-其他費用扣除規定》進行學習。