本題考核行政許可的審查與決定程序。審查分兩種：一種是形式審查，看申請材料是否齊全、是否符合法定形式；另一種是實質審查，對申請材料的實質內容，就其真實性、合法性進行書面審查。所以選項A正確，選項B錯誤。如果認為申請人提交的材料不足以證明其已經符合行政許可的條件，可以要求申請人補充材料，但是不得要求申請人重復提供材料。所以選項C錯誤。行政機關作出準予行政許可的決定，需要頒發行政許可證件的，應當向申請人頒發加蓋本行政機關印章的行政許可證件。所以選項D正確。依法應當先經下級機關審查后報上級機關決定的行政許可，下級行政機關的審査意見只是初步的，上級行政機關作出的決定才是正式的決定。上級行政機關是這種情況下的行政許可權主體。所以選項E正確。