申請人申請行政許可，應當如實向行政機關提交有關材料和反映真實情況，并對其申請材料實質內容的真實性負責。所以選項A正確。根據《行政許可法》的規定，市政府“可以”組織上述四個職能部門聯合辦理，也可以確定一個部門統一辦理，還可以組織上述四個職能部門集中辦理。所以選項B錯誤，選項E正確。建設化工廠直接涉及附近居民的重大利益，根據規定，行政許可直接涉及申請人與他人之間重大利益關系的，行政機關在作出行政許可決定前，應當告知申請人、利害關系人享有要求聽證的權利。所以選項C正確。行政許可采取統一辦理或者聯合辦理、集中辦理的，辦理的時間不得超過45日。題干中并未明確采取上述方式辦理，而且45日還可以延長15日。所以選項D錯誤。